Berawal dari semakin meningkatnya minat santri untuk menghafal dan memahami Al Qur’an ala MMQ, sementara gedung PPMQ Lirboyo tidak mencukupi, maka pada tahun 2004 dibangunlah bangunan baru yaitu Pondok Pesantren Murottilil Qur’an Putra-Putri di Dusun Sidomulyo Desa Kodran Kec. Semen Kediri yang berjarak kurang lebih 2 km dari PPMQ Lirboyo.

Kegiatan dan Jenjang pendidikan yang ada di PPMQ Unit Kodran sama dengan yang ada di PPMQ Lirboyo. Pada mulanya PPMQ Kodran adalah pesantren yang fokus pada pengajian Al-Qur’an, akan tetapi pada akhir-akhir ini PPMQ Kodran telah memiliki Madrasah Diniyyah yang bernama MDMQ (Madrasah Diniyyah Murottilil Qur’an) dengan tenaga pengajar yang rata-rata lulusan Madrasah Hidayatul Mubtadiin (MHM) Lirboyo. Jenjang pendidikan yang berada di MDMQ adalah Tingkat Ibtida’iyah dan Tsanawiyah